东晋南北朝时，二州二郡合治一地，合设一行政长官者称为双头州郡。《晋书·地理志一》说：“江左分梁为秦，又立氐池为北秦州。”故秦州又称南秦，与梁州合治南郑(今陕西省汉中县);又，西晋永嘉后侨置巴西郡，与梓潼郡同治涪县(今四川省绵阳市东)，合称巴西梓潼二郡。北朝亦有双头郡，《魏书·地形志》载南疆颍楚二州所统有双头郡：颍州领郡二十，其中单郡仅两个，双头郡竟有九个，除东郡汝南一双头郡外，均为梁武帝所置而为北魏所沿置;楚州领郡十二，亦有两个双头郡。双头郡的太守，其衔称前连书两郡之名，如《宋书·刘道怜传》记“刘秉为前将军、淮南宣城二郡太守。”
