南京市国家税务局成立于1994年10月，下辖16个区县局、1个直属分局（大企业管理局）、1个稽查局，1个车购办，现有干部职工2161人，稽管纳税人19.9户，其中增值税纳税人17.3万户（一般纳税人4.1万户），企业所得税纳税人9.1万户。主要负责增值税、消费税、企业所得税、储蓄存款利息个人所得税、车辆购置税、金融保险营业税等税种以及进出口税收的征管工作。2018年7月5日上午，南京市国税局、地税局正式合并，国家税务总局南京市税务局揭牌。
