仙游县卫生局是仙游县人民政府主管全县卫生事业的职能部门，承担着全县医疗、预防、保健、爱国卫生等卫生行政管理职能，内设三个职能股：办公室、医政防保股。挂靠单位有：县爱国卫生运动委员会办公室。全县现有各级各类医疗机构380家，其中综合性医院3家（公立医院1家，民营医院2家），专科医院1家（南门妇产专科医院），妇幼保健院1家，皮肤病防治院1家，精神病防治院1家，乡镇卫生院17家，社区卫生服务中心1家，门诊部6家，医务所（室）3家，个体诊所33家，社区卫生服务站7家，村卫生所306个。编制床位1555床，现有卫技人员2846人，另有乡村医生745人。基本满足了全县人民群众医疗预防保健需求。