当依豆豆正和卖报的老爷爷商量事情的时候，一扭头，却发现牛豆豆不见了。近来豆豆村出现了一桩怪事，接二连三地有豆豆莫名地消失，而且消失大多是平时勤奋好学的豆豆，好往书堆里钻，相当一部分豆豆还是豆豆书屋的常客。牛豆豆是依豆豆的弟弟，胆儿大，虽然豆豆书屋陡然冷清了不少，他却仍是雷打不动地往那儿跑，未有丝毫害怕。就在刚才，他还陪姐姐去卖了几份报纸。可转眼间，就凭空消失了……
别人消失了，依豆豆可以不管，但牛豆豆不行。父母去世得早，在牛豆豆还躺在襁褓中的时候，豆豆父母去县城采购化肥食用，就再也没回来过。有豆豆回来说，依豆豆父母被狠心的商贩拉进豆筒里榨成了豆浆，正以一杯一元五毛钱的价格出售着。豆渣被废弃在一旁，里面就有依豆豆与牛豆豆的父母。依豆豆曾背着牛豆豆到那个豆渣桶四下寻找，那么多无辜死去的豆豆，又都死得惨不忍睹，面目全非，不知道哪个才是自己的父母，还险些为此搭上了自己和牛豆豆的性命，只好无奈地放弃。自那以后，牛豆豆就是自己唯一的亲人，依豆豆靠着卖报得来的微薄的工资将弟弟抚养长大，必须将他找回来。
依豆豆喊上了胆大的绵豆豆和骁勇善战的乌豆豆，自己用皮筯和小竹竿自制成弓，在箭筒上放上几根牙签当箭，又去铁匠铺打了一把剑，别在自己的腰间，略微整了整行装，就出发了。沿路走来，遇到过绑架绵豆豆的蚱蜢，表面善良却暗中投毒的蚂蚁，穷追不舍地苍蝇，好几次绵豆豆险些丧生，都被救了回来。也不知走了多远，总之是太阳落了又升，升而后落，终于进入一个祥和安谧的境地。远远地望见一座高大建筑物耸立，红色屋顶触及云端，雪白的屋身醒目地簇拥在蓝天之中。依豆豆不觉舒了口气，连日来的奔波，已经累了。乌豆豆的脸上也挂满了伤痕，不再是那个光滑如漆的乌豆豆了，绵豆豆更是浑身上下都青一块紫一块，浑身上下没一块好豆皮。
等他们拖着疲惫的身躯，靠近那栋雄伟的建筑物时，已接近天黑了，屋内透出柔和而又温馨的灯光。他们走到门前，门虚掩着，轻柔的灯光沿着门缝泻出了门外。敲了敲门，无人来应。依豆豆轻轻推了推门，门“嘎吱”一声开了，她迎着晕黄的灯光，大步跨入了屋内。乌豆豆和绵豆豆面面相觑，也顺着依豆豆的脚步走进了屋。
屋里空无一人，正面的墙壁中央挂了一面钟，秒针走动的“嘀嗒”声清晰地回荡在屋内，时钟下摆着各式各样的木柜，木柜上摆着各式各样的蛋糕，大大小小也不尽相同。蛋糕前摆着特殊材料制成的小长条，长条上似乎刻有字样。绵豆豆俯身一看，不禁大嚷一句：“看，这是乌豆豆的名字”，果然，构式精巧美丽的蛋糕前有块小长条上端端正正地刻着“乌豆豆”三个字样。绵豆豆随即马上去找自己的名字，在一个小角落里，找到了属于自己的蛋糕。绵豆豆用手指沾了沾自己的蛋糕，“味可真淡，不好吃呢”，又瞅了瞅蛋糕，“哎，样式也不好看。”绵豆豆是个贪吃的孩子，突然想起属于乌豆豆的那块蛋糕，便跑去用手指沾了沾，发现甜而不腻，绵豆豆在村里是出了名的嘴馋，便不知不觉地将蛋糕吃了大半。依豆豆吃惊地看着正在逐渐透明化的乌豆豆，他正在滔滔不绝地跟依豆豆说着话，对自己透明化的事情浑然不知。依豆豆突然想起了什么，回头冲绵豆豆喊了一句：“别吃了！！”绵豆豆停止了大嚼，猛一回头，也吃惊地盯着乌豆豆。乌豆豆觉得不自在了，往自己身上一看，不禁“哎呀”叫出声来。
依豆豆：“绵豆豆，别吃了，再吃，乌豆豆会消失的。”
绵豆豆：“这倒底是怎么一回事啊，我吃个蛋糕和乌豆豆有什么关系？”
“如果我没猜错，这儿应该有一摞没有蛋糕的长条子”依豆豆四下里搜寻着说，“绵豆豆，你那脚边是什么？”
绵豆豆抹了抹嘴边的蛋糕，看了看脚边，似乎码着一摞东西，她蹲下身把他们拾了起来：“依豆豆，上面全是消失的豆豆的名字，包括牛豆豆。”
“我想我知道原因了”依豆豆沉吟了半晌，“我曾经听过一个传说，说豆豆村的每颗豆豆，都有属于自己的时间蛋糕……”
“时间蛋糕？”乌豆豆和绵豆豆嚷了起来。
“对，时间蛋糕，它代表着每一颗豆豆的生命，蛋糕的大小代表所剩的生命力。所余的蛋糕有多少，生命便剩多少。不受外力的干扰下，蛋糕会随着时间的流逝慢慢变小。蛋糕上面的花样代表着自己的充实程度，蛋糕越精巧，花样越多，却甜而不腻的，代表自己过得越充实，时间蛋糕损耗也会相应地慢一些;相反，蛋糕越简单，花样越少，却淡而无味的，就代表虚度光阴的程度越厉害，时间蛋糕变小的速度也快一些。”
绵豆豆恍然大悟，“怪不得我的蛋糕那么难吃啊！”
乌豆豆怨恨地看了一眼绵豆豆：“怪不得我便成了透明状……可是，问题在于，为什么像牛豆豆之类的年轻人那么快就没蛋糕了？”
依豆豆说：“牛豆豆好学，所以他的蛋糕一定很美味可口，遭到偷吃的可能性很大，所以接下来我们的任务是……”
“抓小偷！！！”乌豆豆和绵豆豆异口同声道。
正说着，见一只硕大无比的老鼠爬上了蛋糕柜啃起了蛋糕。“好啊！偷吃贼终于现身了”依豆豆恨恨地想，随即从箭筒里取出了根牙签，搭上弓，只听“嗖”地一声，箭头不偏不倚地射中鼠的眼睛，老鼠顿时惊慌失措起来，上下乱蹿。
“糟糕，别让它打翻了蛋糕！！！”依豆豆话音未落，老鼠已重重跌落在乌豆豆的半块蛋糕上，被撞击的蛋糕在桌沿晃了晃，“叭”地摔倒在地，乌豆豆也伴着“叭”地声响，化于无形的空气中。依豆豆又一发离弦之箭射中鼠头。老鼠顿时趴在地上，挣扎了会，就不再动弹。偌大的屋子里就只有一堆蛋糕、依豆豆、绵豆豆和一只死去的老鼠。依豆豆不禁伤心落泪，绵豆豆边哭边道：“依豆豆，都是我不好，要是我不吃那半块蛋糕，老鼠也撞不飞它啊”正在互相垂泪之时，朦胧听见一个声音：“放我出去，我来救他。”依豆豆止住了哭泣，寻声而起“你在哪？你是谁？”
“我在老鼠肚里呢，我是看守蛋糕的神”，果然，从老鼠肚里传来闷闷的声音。依豆豆拨出腰间的剑，将老鼠肚皮一划，一个带着彩色光圈的小老头钻了出来：“闷死我了，依豆豆，谢谢你。”
看见依豆豆纳闷的眼神，小老头又接着说：“我掌管着你们豆豆村所有豆豆的时间蛋糕，自然知道你的名字，所以不用纳闷。”
“您真的能救乌豆豆吗？”
“哎，本不应让你们千辛万苦来这，是我失职了。那天喝多了酒，不小心打了个盹，醒来时就发现在老鼠的肚子里了。出又出不来，还险些被它那臭哄哄的胃液给消化了。我的失职给豆豆村带来了麻烦，自然会还豆豆村一个原貌。”说完，用长袖一挥……
等依豆豆醒来时，牛豆豆正守在她身边。是梦？这时屋外传来敲门声，“依豆豆，我们来看你啦！”是乌豆豆和绵豆豆的声音。等乌豆豆和绵豆豆笑嘻嘻进来时，依豆豆瞅了瞅乌豆豆不再光滑的脸，又看了看绵豆豆脸上的膏药，笑了……