交通部直属机构。国民党政府交通部为整理扬子江水道，消弭水患，发展航业起见设置本会。依照民国十七年(公元1928年)三月十三日公布的《交通部扬子江水道整理委员会章程》规定，其职务为测绘水道，疏濬江流，修养航路，防御水灾，协助并指导扬子江流域各部分治水工程及其他关于整理各事项。设委员长一人，由交通部部长或次长兼任，综理会务;委员十人，其中内政、外交、财政、农矿、工商五部各派一人，建设委员会派一人，本部航政司司长一人，本部选派富有河海水利工程经验或具专门学识者三人。本会置技术委员会及总务、工务二处分理事务。技术委员会设主任委员一人，委员四至八人，技术员若干人，办理一切技术事务;遇有技术上之必要得延聘国内外富有河海工程学识经验者充任顾问。总务处设处长一人，课长二至四人 事务员若干人，办理文书、会计及不属于技术委员会与工务处的事务。工务处设处长一人。课长二人，技术员及事务员若干人，办理一切工程事务。本会于整理水道有必要时得酌量情形会同地方官署禁止沙洲围垦，清除港口障碍，使用或征收沿江土地;为实地调查或施行工程事得设测量队及工程队，由工务处处长指挥监督之;因缮写文件得酌用雇员。