张芝元，四川清溪人，清朝将领。以千总从副将军明亮征金川有功，积官至越巂营参将。金川酋以番僧诇军事，芝元言於明亮曰：“军事每为贼知，非去其谍，灭贼无日矣。”会大风雪，明亮命芝元率数十人伪若以他事出者，宿番僧寺中。芝元故通番语，与僧饮甚欢，僧醉眠，芝元出寺聚柴焚之，僧皆死。贼谍断，因招降其众。寻从成都将军特成额驻兵江卡，捕夹坝，围本肯贼寨，焚其碉，毙贼甚众，擢懋功协副将。
